הגורם שמשפיע על עלויות החימום התת רצפתי הוא למעשה האמצעי שמחמם את המים של המערכת. את המים ניתן לחכם בעזרת חשמל,סולר, גז או נפט, אך השיטה היעילה והזולה ביותר היא חימום בעזרת משאבות חום אינוורטר. עלות הפעלת המשאבות מגיעה לכ- 25% מעלות החימום בשיטות האחרות, ולכן בשנים האחרונות ישנו מעבר לחימום בשיטה זו. המשאבות חום הללו גם ידידותיות יותר לסביבה מהמתחרים שלהן, השימוש בהן נוח יותר, מכיוון שמהשאבות מתחברות לרשת החשמל הביתית ואינן מצריכות אספקה נפרדת של סולר או
נפט.
